macOS High Sierra へアップデートすると，SSD が搭載されている端末ではシステムのボリュームのファイルシステムが自動的に HFS+ から APFS に変換されます．その他の HFS+ のディスクもディスクユーティリティを使って APFS に変換することが出来ますが，Time Machine に利用しているディスクを APFS に変換してはいけないようです．
更新: macOS Big Sur 11 以降では Time Machine のバックアップ先として APFS を利用できます．